L'aeroporto di Bari (BRI), intitolato a Karol Wojtyla, è il principale aeroporto della Puglia.

L'aeroporto dista circa 12 km dal centro città ed è raggiungibile in autobus in circa 30 minuti. Il servizio è disponibile ogni ora dalle 5:00 alle 23:00. Inoltre, Pugliairbus offre un servizio shuttle dall'aeroporto di Bari agli aeroporti di Brindisi e Foggia e alle città di Taranto e Matera.
Per chi arriva in auto da nord: una volta superato il casello di Bari Nord, prendere la tangenziale in direzione Foggia, e uscite all'aeroporto. Per chi arriva da sud: superato il casello di Bari Sud, immettetevi sulla SP 271 in direzione Bari, prendete la tangenziale in direzione Foggia e poi uscite all’aeroporto.
Presso l’aeroporto sono disponibili 3 parcheggi per un totale di 2.150 posti auto. Per esplorare la Puglia in auto, è possibile noleggiarne una da diverse compagnie nell'aeroporto di Bari.

Air Dolomiti mette a disposizione voli diretti dall'aeroporto di Bari a Monaco di Baviera.